第7章 新发病例

疾控地带 华胥云 1122 字 2024-04-21

王亚楠带着叶蓁蓁去了实验楼的计算机房,所有需要进行序列分析,建立进化树,基因测序的后续工作都在计算机房完成。

g省疾控计算机房规模颇大,六七十平米的房间里放着八台电脑,西面还放着一排文件柜,柜子前是一排办公桌,很空旷的感觉。

计算机房里已经有两个人坐在电脑前,王亚楠带着叶蓁蓁走进机房,众人点点头算是打过招呼。

王亚楠在一台电脑坐下,打开电脑,随手拖过来一张旋转椅让叶蓁蓁坐在旁边。

叶蓁蓁坐在一旁,看着王亚楠从电脑中调出昨天做出的炭疽杆菌序列图,看了两眼,叶蓁蓁就发现了问题,一个单独的序列突出在众序列之外,序列后面用英文标注着毒株名称,baizianthracis,叶蓁蓁指着电脑屏幕上单突出来的序列,问:“这就是从百子村死者身上分离出来的炭疽杆菌吧?”

“是的,下面这些是从国内各个炭疽流行区选出来的具有代表性的序列,对比分析后,从百子村新分离出来的这株炭疽杆菌因为与其他的同源性太低,所以系统软件将其单列出来一个分支。”周亚楠一边盯着电脑屏幕,一边用纳闷的口气说,“这就是这次炭疽疫情最奇怪的地方。”

叶蓁蓁心想,不会是新出现的变异株吧?每次细菌或病毒发生大的变异时,致病力都会发生相应的改变,这次百子村的祖孙四人发病急,症状严重,可能就是因为新出现的炭疽杆菌发生变异的缘故。

叶蓁蓁说出自己的想法,周亚楠点点头,解释说:“这个变异的可能,我之前也想过,所以打算今天对其中的几个毒力基因做一下分析。”

周亚楠开始调出各种炭疽杆菌的毒力基因,开始对比分析,边操作软件边说:“我们g省疾控用的这些序列分析软件还是南主任推荐的,分析方法也是之前去中国cdc统一培训过的,叶老师,这套分析软件和方法您也很熟悉吧?”

“嗯,这套分析软件是现在国际通用的,发表sci论文的时候也认可这种方法。”

叶蓁蓁心想着,这套分析方法最初还是南之乔在巴黎的巴斯德研究所教会了自己,后来到了中国cdc南之乔的实验组,用的就更频繁了,每次做各种病毒的进化树,南之乔总是要求将国际上所有分离测序出来的代表毒株都放进进化树里,说是这样能全面分析,发现一些意想不到的东西……